「清華哲學書系」是國立清華大學哲學研究所推動建立的書系，出版清大哲學所同仁與國內外哲學學者的著作，希望聚樹成林，厚植台灣哲學研究根基。林深鳥自集：我們希望密納瓦的貓頭鷹，化作台灣草鴞，在夜幕低垂的林間遙相呼應。

學術社群與學術傳統的建立，是學術發展的不二法門：我們希望清華哲學書系可以兼容並蓄，出版各種哲學專書論著，對此有所貢獻。此外，要厚植哲學研究的學術根基，紮實的經典譯注乃至對經典著作所做的嚴謹學術性的導讀與詮釋，也是不可或缺的：我們希望清華哲學書系可以出版國外哲學經典著作的中文譯注與導讀和詮釋書籍，供教學與研究使用，讓這些經典說中文，從而也讓華語界可以用中文談這些經典。

哲學是文化的一個重要的組成部分：我們希望，清華哲學書系的持續出版，可以為台灣哲學的發展、從而為台灣文化的發展注入活水，讓水清木華之地，成為婆娑之島的重要文化源頭之一。